Solo dos institutos oficiales funcionan en Choluteca. Durante 2018 se reportó una matrícula de 8,506 alumnos, de ellos 3,171 cursaban sus estudios de media en el sector privado
La construcción de la nueva sede del transporte interurbano estará alzando su vuelo en 2019 y se espera que culmine en el lapso de un año y medio. Costará 175 millones de lempiras