'Cualquier persona que sea detectada tratando de ingresar a nuestro país por un punto ciego (de la frontera) será llevado a prisión', advirtió el mandatario en Twitter.
El miércoles, El Salvador prohibió por 21 días el ingreso de todo extranjero para prevenir el coronavirus.
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Las autoridades han identificados 142 puntos en la frontera terrestre utilizados para ingresar ilegalmente a territorio salvadoreño.
Bukele señaló que 2,000 soldados se encargarán de custodiar la frontera, junto a un número indefinido de policías.
El mandatario ordenó además prohibir las aglomeraciones de más de 200 personas, como parte de las medidas de 'alerta roja' para prevenir el Covid-19.
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Y pidió a las instituciones que componen el Sistema Nacional de Emergencias que se activen para monitorear y atender emergencias las 24 horas del día.
Cuerpo de Bomberos, Cruz Roja, Cruz Verde, Comandos de Salvamento, Instituto del Seguro Social, ministerio de Salud, Fuerza Armada y la policía deberán activar sus protocolos de emergencia.
En tanto, el presidente del Congreso, Mario Ponce, adelantó a la prensa que la Asamblea Legislativa podría aprobar este viernes un decreto para declarar 'estado de emergencia y calamidad pública' en el país.
El estado de emergencia permite al gobierno disponer de fondos de emergencia y solicitar ayuda internacional para destinarlos a la atención de la pandemia de coronavirus.